Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPTEP56180 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms