Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERFP50548 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERFP50548 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERFP50548 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms