Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBP2P50120 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms