Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLK1P49759 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLK1P49759 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms