Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRIM2P49643 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms