Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CX3CR1P49238 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms