Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A3P48764 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms