Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms