Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIK3CBP42338 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CBP42338 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms