Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARGP37231 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms