Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP62P37198 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms