Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHI3L1P36222 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms