Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THBS4P35443 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THBS4P35443 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
THBS4P35443 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THBS4P35443 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THBS4P35443 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THBS4P35443 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms