Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTF4P34130 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTF4P34130 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF4P34130 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF4P34130 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms