Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC12P31275 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms