Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAP3P28838 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAP3P28838 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAP3P28838 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms