Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP1P28562 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms