Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMLP26374 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMLP26374 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms