Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO2P25791 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO2P25791 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms