Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPREP23469 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPREP23469 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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