Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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