Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XBP1P17861 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XBP1P17861 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms