Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCFC2P16383 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms