Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT10P13645 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT10P13645 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT10P13645 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT10P13645 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms