Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MTHFD1P11586 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms