Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms