Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4AP0C0L4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4AP0C0L4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms