Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB5P09067 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXB5P09067 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB5P09067 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms