Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC3A2P08195 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC3A2P08195 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms