Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOA1P02647 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms