Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHG1P01857 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms