Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms