Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN7O95471 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms