Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms