Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG13O75143 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG13O75143 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG13O75143 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms