Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSVO60911 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSVO60911 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSVO60911 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms