Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOFO60613 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms