Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSX5O60225 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms