Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRY3O43610 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms