Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTSS1O43312 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms