Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PHF1O43189 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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