Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSPLO15194 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms