Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms