Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIP1O00291 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIP1O00291 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIP1O00291 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIP1O00291 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIP1O00291 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIP1O00291 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HIP1O00291 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIP1O00291 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms