Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms