Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A6NIN4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A6NIN4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A6NIN4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A6NIN4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms