Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PLEKHD1A6NEE1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLEKHD1A6NEE1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms