Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD3L3A6NE82 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD3L3A6NE82 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms