Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL33A6NCF5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms