Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM221AA4D161 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms